जलप्रदूषणाचे सर्वात मोठे कारण म्हणजे पाण्याची गुणवत्ता कमी होणे. याच्या सेवनाने अनेक प्रकारचे आजार होऊ शकतात. खरे तर, भारतातील आरोग्याच्या खालच्या पातळीचे, विशेषतः ग्रामीण भागात जलप्रदूषण हे एक प्रमुख कारण आहे. प्रदूषित पाण्यामुळे कॉलरा, क्षयरोग, जुलाब, कावीळ, उलट्या, जुलाब असे आजार होऊ शकतात.