शहराच्या केंद्रापासून सुमारे 27 किमी अंतरावर असलेले कोचीन आंतरराष्ट्रीय विमानतळ एर्नाकुलम शहराला सेवा देते. दिल्ली, मुंबई, कोलकाता, हैदराबाद इत्यादी प्रमुख ठिकाणांहून प्रवासी थेट फ्लाइटमध्ये चढू शकतात.