नॉनपॉइंट स्त्रोत प्रदूषण नियंत्रित करणे कठीण आहे कारण ते विविध स्त्रोत आणि स्थानांमधून येते. बहुसंख्य नॉनपॉइंट स्त्रोत प्रदूषण प्रवाहाच्या परिणामी उद्भवते.