चुनखडीचे दोन उत्पत्ती आहेत: (१) समुद्राच्या पाण्यापासून होणारा बायोजेनिक पर्जन्य, चुना-स्त्राव करणारे जीव आणि फोरामिनिफेरा हे प्राथमिक घटक आहेत; आणि (2) यांत्रिक वाहतूक आणि आधीपासून अस्तित्वात असलेल्या चुनखडीचे निक्षेप, क्लॅस्टिक निक्षेप तयार करणे. ट्रॅव्हर्टाइन, तुफा, कॅलिचे, खडू, स्पेराइट आणि मायक्रिट हे चुनखडीचे सर्व प्रकार आहेत.