माणसाच्या आतड्यात राहणार्‍या प्रोटोझोआचे दुसर्‍या माणसात संक्रमण सामान्यत: मल-तोंडी मार्गाने होते (उदाहरणार्थ, दूषित अन्न किंवा पाणी किंवा व्यक्ती-ते-व्यक्ती संपर्क).