शेतीमध्ये वापरल्या जाणार्‍या कीटकनाशके आणि खते भूगर्भातील आणि पृष्ठभागाचे पाणी दूषित करू शकतात , जसे की सेंद्रिय पशुधन कचरा, प्रतिजैविक, सायलेज वाहून नेणारा कचरा आणि वृक्षारोपण पिकांमधून प्रक्रिया करणारे कचरा