अन्न वनस्पती पीक प्रणालीमध्ये, सूक्ष्मजीव महत्त्वपूर्ण कार्ये आणि पर्यावरणीय सेवा प्रदान करतात, जसे की जैविक कीटक आणि रोग नियंत्रण, वनस्पतींच्या वाढीस प्रोत्साहन आणि पीक गुणवत्ता आणि सेंद्रिय पदार्थ आणि प्रदूषकांचे जैवविघटन.