सचिवालय आंतर-मंत्रालयीय समन्वय सुनिश्चित करून, मंत्रालये/विभागांमधील मतभेद दूर करून आणि सचिवांच्या स्थायी/तदक समित्यांच्या साधनाद्वारे एकमत विकसित करून सरकारमध्ये निर्णय घेण्यास मदत करते.