या सेंद्रिय संयुगे आणि अजैविक संयुगे यांच्यातील प्राथमिक फरक हा आहे की सेंद्रिय संयुगेमध्ये नेहमीच कार्बन अणू असतो, तर बहुतेक अजैविक संयुगेमध्ये कार्बन अणू नसतो . जवळजवळ सर्व सेंद्रिय संयुगेमध्ये कार्बन-हायड्रोजन किंवा एक साधा CH बंध असतो.