हवामानातील बदल आणि नद्या कोरडे पडणे यासारख्या भौगोलिक बदलांमुळे हडप्पा संस्कृतीचा अंत झाला. हे देखील स्पष्ट केले आहे की जंगलतोड आणि पूर ही हडप्पा संस्कृतीची महत्त्वपूर्ण कारणे म्हणून ओळखली जातात.