सूक्ष्मजीव सेंद्रिय पदार्थांच्या विघटनासाठी जबाबदार असतात कारण ते जटिल संयुगे तोडतात आणि साधे पदार्थ सोडतात. प्र. वनस्पती आणि प्राण्यांच्या मृत शरीरातील सेंद्रिय पदार्थांचे सूक्ष्मजीवांद्वारे अजैविक पदार्थांमध्ये रूपांतर होते.