ठिबक सिंचन प्रणालीचे तोटे खाली दिले आहेत: उच्च प्रारंभिक गुंतवणूक आवश्यकता. ठिबक सिंचन उपकरणे बदलण्यासाठी नियमित भांडवलाची आवश्यकता. ठिबक सिंचन उत्सर्जक अडथळे आणि बिघडलेले कार्य असुरक्षित असतात.