संरक्षण सचिव हे विभागातील सर्वोच्च दर्जाचे नेते आहेत आणि संरक्षण धोरणावर राष्ट्रपतींचे प्रमुख सल्लागार, सशस्त्र दलांचे प्रमुख कमांडर म्हणून काम करतात.